Действие фильма разворачивается в мире, захваченном искусственным интеллектом, который использует людей в качестве источника энергии. Основной герой, программист по имени Нео, обнаруживает, что его реальная жизнь является иллюзией, созданной компьютерной программой под названием Матрица. Вместе с группой повстанцев, возглавляемых Морфеусом, Нео начинает бороться за свободу человечества. В ходе своего путешествия Нео обучается управлять Матрицей и своими собственными способностями, пытаясь разгадать тайны этого мира и найти способ освободить людей от гнета машин. Главной целью становится победа над кибер-тэррористом агентом Смитом и полное освобождение человеческого общества от рабства и контроля Матрицы.